Sous-marin est une transformation de Kirby et du Prince PonPon apparaissant dans Kirby - Au fil de l'aventure et Kirby : Au fil de la grande aventure. Les deux personnages prennent cette forme automatiquement quand ils entrent dans l'eau. Sous cette forme, Kirby prend l'apparence d'un sous-marin rose avec un périscope et une hélice rouges. Le Prince PonPon devient quant à lui un sous-marin bleu avec un périscope et une hélice oranges.
Sous cette forme, Kirby et le Prince PonPon peuvent nager rapidement sous l'eau en maintenant le bouton 2. C'est la seule forme où Kirby conserve la pleine utilisation de la Ficelle et la capacité de lancer des projectiles de fil. Le potentiel de la ficelle est augmenté et peut désormais être lancée vers le bas également, couvrant les 8 directions au lieu de seulement 5 à terre. La ficelle de Kirby sera rouge au lieu de rose et il en va de même pour PonPon, car sa ficelle bleue sera désormais orange. Kirby et le Prince portent des boules de fil au-dessus de leur sous-marin, tout comme à terre.